Protein–RNA interactions for Protein: O09102

Gcm2, Chorion-specific transcription factor GCMb, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm2O09102 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gcm2O09102 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gcm2O09102 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms