Protein–RNA interactions for Protein: O09009

Rfng, Beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase radical fringe, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfngO09009 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RfngO09009 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RfngO09009 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfngO09009 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfngO09009 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfngO09009 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms