Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Hps1O08983 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps1O08983 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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