Protein–RNA interactions for Protein: O08740

Polr2j, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2jO08740 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Polr2jO08740 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Polr2jO08740 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms