Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3aO08665 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms