Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MttpO08601 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MttpO08601 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MttpO08601 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MttpO08601 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MttpO08601 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MttpO08601 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
MttpO08601 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
MttpO08601 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms