Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm2056J3QQ02 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm2056J3QQ02 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms