Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Smim22J3QP37 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms