Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Cldn34c2J3QNM1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Cldn34c2J3QNM1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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