Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm11236J3QMS7 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm11236J3QMS7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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