Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm21818J3KMS6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm21818J3KMS6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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Gm21818J3KMS6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm21818J3KMS6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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