Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Gm20828J3KMI7 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20828J3KMI7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Gm20828J3KMI7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm20828J3KMI7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm20828J3KMI7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm20828J3KMI7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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