Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tubgcp6G5E8P0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubgcp6G5E8P0 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms