Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nccrp1G3X9C2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nccrp1G3X9C2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms