Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trim55G3X8Y1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trim55G3X8Y1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms