Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vmn2r85G3UW56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vmn2r85G3UW56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms