Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srp72F8VQC1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Srp72F8VQC1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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