Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Colca2F8VPY8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms