Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Farp1F8VPU2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Farp1F8VPU2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms