Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arid4aF8VPQ2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arid4aF8VPQ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arid4aF8VPQ2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms