Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Gm28038F7BCN9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Gm28038F7BCN9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm28038F7BCN9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm28038F7BCN9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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