Protein–RNA interactions for Protein: F6XK35

Gm21876, Predicted gene, 21876, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21876F6XK35 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm21876F6XK35 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21876F6XK35 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms