Protein–RNA interactions for Protein: F6XGJ4

Gm17093, Predicted gene 17093 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17093F6XGJ4 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm17093F6XGJ4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm17093F6XGJ4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms