Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Gm5861F6VCN9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm5861F6VCN9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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