Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pagr1bF6V0H0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pagr1bF6V0H0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms