Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Gm17555F6U8B9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gm17555F6U8B9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gm17555F6U8B9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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