Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm28305F6U473 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Gm28305F6U473 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Gm28305F6U473 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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