Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Syngap1F6SEU4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms