Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm340F6RGI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm340F6RGI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms