Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Erich3F6QRE9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Erich3F6QRE9 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms