Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Urb2E9Q7L1 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Urb2E9Q7L1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms