Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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Usp31E9Q6Y8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
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Usp31E9Q6Y8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Usp31E9Q6Y8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Usp31E9Q6Y8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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