Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Srsf11E9Q6E5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Srsf11E9Q6E5 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.4 ms