Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BC005561E9Q5E2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BC005561E9Q5E2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms