Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vmn2r56E9Q4U5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms