Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
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ApobE9Q414 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
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ApobE9Q414 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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ApobE9Q414 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
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ApobE9Q414 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
ApobE9Q414 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
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