Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CenpfE9Q3P4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms