Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3C1

C2cd2, C2 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd2E9Q3C1 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C2cd2E9Q3C1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C2cd2E9Q3C1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms