Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tarbp1E9Q368 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp1E9Q368 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms