Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
5430401F13RikE9Q328 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms