Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms