Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc171E9Q1U1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc171E9Q1U1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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Ccdc171E9Q1U1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc171E9Q1U1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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