Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krt78E9Q0F0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Krt78E9Q0F0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms