Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdr1E9Q0B4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdr1E9Q0B4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms