Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Scaf11E9PZM7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Scaf11E9PZM7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms