Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Sfta2E9PXB6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms