Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Col6a3E9PWQ3 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms