Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc8E9PWG2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc8E9PWG2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms