Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3298E9PW80 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm3298E9PW80 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms