Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3002E9PW72 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3002E9PW72 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms